Nadzorni odbor nadzire provođenje Statuta i drugih propisa Komore, materijalno-financijsko poslovanje i raspolaganje sredstvima, donosi Poslovnik o radu Nadzornog odbora.
Nadzorni odbor ima predsjednika i četiri člana, on podnosi Skupštini izvješće o radu i financijskom poslovanju, najmanje jednom na godinu. Predsjednik Komore predstavlja i zastupa Komoru, odgovoran je za zakonitost rada. U radu mu pomažu tri potpredsjednika i tajnik Komore. Mandat mu traje 4 godine, a može i ranije ako je razriješen po odluci Skupštine, ostavkom, smrću ili gubitkom statusa člana Komore. On predsjedava sjednicama Skupštine i Upravnog odbora, usklađuje aktivnosti tijela komorskog sustava, brine o zakonitosti rada Komore, .. On svoje ovlasti može prenijeti na drugu osobu. Predsjedništvo komore je savjetodavno tijelo, a čine ga predsjednik i tri potpredsjednika Komore. Stalni odbori i komisije Upravnog odbora su:
-Odbor za gospodarstvo,
-Odbor za strukovnu izobrazbu,
-Odbor za sajmove i druge promidžbene aktivnosti,
-Odbor za informiranje,
-Odbor za financije i proračun,
-Odbor za praćenje i razvitak komorskog sustava i Statut,
-Odbor za pitanja problema umirovljenih obrtnika i
-Komisija za dodjelu priznanja Komore.

Odbori i komisije najviše mogu imati sedam članova. Pri Komori se osniva i Sud časti.

Sud časti sudi članicama i članovima komore zbog povreda dobrih poslovnih običaja u obavljanju djelatnosti, prometa robe i usluga u prometu robe na području Komore, kao i zbog povreda Statuta Komore, bilo da je to između članova ili prema trećim osobama.
Za sve povrede može se izreći mjera opomene, javna opomena uz objavu u tisku, prijedlog za oduzimanje obrtnice, privremeno ili trajno oduzimanje prava primanja naučnika na naukovanje, zabrana obnašanja dužnosti u tijelima Komore.
Protiv odluke Suda časti, može se u roku od 15 dana podnijeti žalba drugostupanjskom vijeću-a presuda drugostupanjskog vijeća je konačna. U Komori djeluje i Arbitraža za posredovanje radi mirenja te za odlučivanje u sporovima o pravima kojima mogu slobodno raspolagati, ako zakonom nije određeno, da za odlučivanje o određenoj vrsti sporova postoji isključiva stvarna, ili međunarodna nadležnost domaćeg redovitog suda.
Hrvatska obrtnička komora, svoja sredstva za rad osigurava iz doprinosa koji plaćaju članovi, iz prihoda iz proračuna, prihoda od imovine itd.